知识产权海关保护，是指当发现货物侵犯知识产权时，海关依法采取的禁止货物进出口的保护措施。在世界贸易组织《与贸易有关的知识产权协议》中被称为知识产权“边境措施”。

     知识产权海关保护有依申请的保护和依职权的保护两种模式。

    （一）依申请保护。指知识产权权利人发现侵权嫌疑货物即将进出口后向海关提出申请，海关根据知识产权权利人的申请扣留侵权嫌疑货物。依申请保护模式又被称为“被动保护”模式，因为在这一模式下，海关不会主动采取制止侵权嫌疑货物进出口的措施。

    （二）依职权保护。指海关在对进出口货物的监管过程中，若发现进出口货物涉嫌侵犯已在海关总署备案的知识产权的，将主动采取扣留和调查处理措施。由于在依职权保护模式下，海关有权主动采取制止侵权货物进出口的措施，因此这一模式又被称作“主动保护”模式。应当注意的是，依职权保护模式仅适用于知识产权权利人事先将其知识产权向海关总署备案的情形。